Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18532 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18532 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms