Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18526 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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