Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P10404 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P10404 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P10404 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P10404 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms