Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms