Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms