Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01655 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01655 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01655 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms