Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms