Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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