Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms