Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MttpO08601 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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MttpO08601 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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