Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms