Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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