Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms