Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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