Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm10378F6XQQ1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10378F6XQQ1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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