Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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