Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Myo5cE9Q1F5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms