Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms