Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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