Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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