Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apol6B7ZC55 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms