Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms