Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms