Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms