Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms