Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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