Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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