Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms