Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms