Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf394Q9Z1D9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms