Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl8Q9Z121 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl8Q9Z121 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms