Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms