Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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