Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefQ9JLC6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefQ9JLC6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms