Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Upk3aQ9JKX8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Upk3aQ9JKX8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Upk3aQ9JKX8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Upk3aQ9JKX8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms