Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms