Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Mrpl39Q9JKF7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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