Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms