Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms