Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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