Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Borcs6Q9D6W8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Borcs6Q9D6W8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Borcs6Q9D6W8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Borcs6Q9D6W8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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