Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms