Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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