Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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