Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms