Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcf1Q9CTH6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms