Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nudt21Q9CQF3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms