Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms