Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms