Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims1Q99NE5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms